Lompat ke konten Lompat ke sidebar Lompat ke footer

Genom Ikan Siput Baru Mengungkap Bagaimana Mereka Beradaptasi dengan Tekanan Kehidupan Laut Dalam

Sekuens genom utuh baru untuk ikan siput hadal Yap memberikan wawasan tentang bagaimana ikan yang tidak biasa bertahan di beberapa bagian laut yang paling dalam. Xinhua Chen dari Universitas Pertanian dan Kehutanan Fujian dan Qiong Shi dari Akademi Ilmu Kelautan BGI menerbitkan analisis mereka tentang genom baru 13 Mei di jurnal PLOS Genetics .
IMAGES
Gambar: 4.bp.blogspot.com

Hewan yang hidup di lingkungan laut dalam menghadapi banyak tantangan, termasuk tekanan tinggi, suhu rendah, sedikit makanan, dan hampir tidak ada cahaya. Ikan adalah satu-satunya hewan dengan tulang punggung yang hidup di zona hadal - didefinisikan sebagai kedalaman di bawah 6.000 meter - dan siput hadal hidup di setidaknya lima parit laut yang terpisah. Chen, Shi, dan rekan mereka membangun sekuens seluruh genom berkualitas tinggi dari ikan siput hadal Yap untuk memahami bagaimana ia beradaptasi dengan kehidupan di laut dalam. Ikan tersebut ditangkap dari Yap Trench di bagian barat Samudera Pasifik pada kedalaman sekitar 7.000 meter.

Analisis genom baru mengungkapkan banyak adaptasi untuk hidup di lingkungan yang dingin, gelap, dan bertekanan tinggi. Ikan siput membawa gen ekstra untuk perbaikan DNA, yang dapat membantu menjaga genomnya tetap utuh di bawah tekanan tinggi. Ia juga memiliki lima salinan gen untuk enzim yang mengambil senyawa yang diproduksi oleh bakteri di ususnya dan mengubahnya menjadi senyawa yang menstabilkan struktur protein di bawah tekanan hidrostatik tinggi. Ikan siput juga telah kehilangan gen tertentu yang terlibat dalam penglihatan, rasa dan penciuman, yang kemungkinan besar tidak diperlukan di lingkungannya yang gelap dan terbatas makanan.

Temuan baru ini menawarkan petunjuk tentang mekanisme evolusi ikan siput untuk bertahan hidup di palung samudra. Namun, para peneliti menunjukkan bahwa penelitian lebih lanjut akan diperlukan untuk mengkonfirmasi fungsi perubahan genetik ini. Selain itu, urutan genom berkualitas tinggi dapat berfungsi sebagai sumber daya untuk penyelidikan mendalam di masa depan terhadap ikan bekicot dan hewan lain yang hidup di zona hadal.

Chen menambahkan, "Banyak gen yang terkait dengan perbaikan DNA menunjukkan bukti seleksi positif dan telah memperluas jumlah salinan dalam genom ikan bekicot hadal Yap, yang berpotensi mencerminkan kesulitan dalam mempertahankan integritas DNA di bawah tekanan hidrostatis yang tinggi. Lima salinan trimetilamina N- oksida (TMAO)-enzim yang menghasilkan gen monooxygenase-3 yang mengandung flavin (fmo3) dan banyaknya bakteri pembentuk trimetilamina (TMA) di usus ikan siput hadal Yap dapat memberikan TMAO yang cukup untuk meningkatkan stabilitas protein dalam kondisi hadal. "

Powered By NagaNews.Net